Η Μ.Ο.Δ.Υ του Ε.Λ.Κ.Ε στελεχώνεται ανάλογα με τις ανάγκες της σύμφωνα με την κείμενη νομοθεσία και έχει τις κατωτέρω αρμοδιότητες:
(α) υποστήριξη των οργάνων διοίκησης του Ε.Λ.Κ.Ε. και των Επιστημονικών Υπευθύνων των Έργων για την εκπλήρωση της αποστολής του Ε.Λ.Κ.Ε.,
(β) υποβολή εισηγήσεων προς τα όργανα διοίκησης του Ε.Λ.Κ.Ε. για τα θέματα αρμοδιότητας της Μ.Ο.Δ.Υ. και των επιμέρους οργανικών της μονάδων,
(γ) τήρηση των διατυπώσεων δημοσιότητας των αποφάσεων του Προέδρου και του Δ.Σ., των λοιπών εγγράφων, πράξεων και συμβάσεων που σχετίζονται με τις δραστηριότητες του Ε.Λ.Κ.Ε., εκτέλεση των αποφάσεων των οργάνων διοίκησης του Ε.Λ.Κ.Ε. και παρακολούθηση της τήρησης των διαδικασιών που προβλέπονται στον παρόντα Οδηγό Χρηματοδότησης,
(δ) κατάρτιση και παρακολούθηση του προϋπολογισμού του Ε.Λ.Κ.Ε. και των αναμορφώσεών του, παρακολούθηση των προϋπολογισμών των Έργων που διαχειρίζεται ο Ε.Λ.Κ.Ε. και διασφάλιση της ορθής εκτέλεσής τους μέσω της εφαρμογής κατάλληλων ελέγχων και δικλείδων ασφαλείας για την παρακολούθηση των οικονομικών μεγεθών,
(ε) διενέργεια των δημοσιονομικών δεσμεύσεων και τήρηση του Μητρώου Δεσμεύσεων,
(στ) είσπραξη πάσης φύσεως χρηματοδοτήσεων των Έργων που διαχειρίζεται ο Ε.Λ.Κ.Ε. και των ίδιων πόρων του Ε.Λ.Κ.Ε., καθώς και έκδοση τίτλων βεβαίωσης για την είσπραξη απαιτήσεων του Ε.Λ.Κ.Ε., σύμφωνα με τον Κώδικα Είσπραξης Δημοσίων Εσόδων (Κ.Ε.Δ.Ε. ν. 4978/2022, Α’ 190),
(ζ) προσδιορισμός του ύψους των ετήσιων εσόδων του Ε.Λ.Κ.Ε. από ίδιους πόρους και η γνωστοποίηση του ύψους αυτού στο Δ.Σ. έως τα τέλη Φεβρουαρίου του επόμενου οικονομικού έτους,
(η) παρακολούθηση των ταμειακών διαχειριστικών διευκολύνσεων σε Έργα του Ε.Λ.Κ.Ε.,
(θ) παρακολούθηση του οικονομικού αντικειμένου των συμβάσεων που συνάπτει ο Ε.Λ.Κ.Ε. με άλλους φορείς,
(ι) διενέργεια των διαδικασιών για τη σύναψη δημοσίων συμβάσεων για την προμήθεια ειδών, την παροχή υπηρεσιών, την εκτέλεση έργων και μελετών σε βάρος των πιστώσεων του προϋπολογισμού Έργων που διαχειρίζεται ο Ε.Λ.Κ.Ε., παρακολούθηση της εκτέλεσης των δημοσίων συμβάσεων και τήρηση μητρώου προμηθευτών,
(ια) υποστήριξη των διαδικασιών για την επιλογή προσωπικού που απασχολείται σε Έργα του Ε.Λ.Κ.Ε. και τήρηση μητρώου φυσικών προσώπων που αμείβονται, με οποιαδήποτε συμβατική σχέση, σε βάρος των πιστώσεων του προϋπολογισμού Έργων που διαχειρίζεται ο Ε.Λ.Κ.Ε.,
(ιβ) έλεγχος νομιμότητας και κανονικότητας των δαπανών βάσει των νόμιμων δικαιολογητικών τους, εκκαθάριση και έκδοση ενταλμάτων πληρωμής,
(ιγ) έλεγχος και εκκαθάριση αποδοχών, δαπανών μετακίνησης και κάθε είδους αποζημιώσεων για το κάθε είδους προσωπικό που απασχολείται σε Έργα του Ε.Λ.Κ.Ε.,
(ιδ) παρακολούθηση της λογιστικής και διαχειριστικής κίνησης των Έργων που διαχειρίζεται ο Ε.Λ.Κ.Ε.,
(ιε) τήρηση των λογιστικών βιβλίων και σύνταξη των προβλεπόμενων χρηματοοικονομικών καταστάσεων, του απολογισμού και των δημοσιονομικών αναφορών,
(ιστ) έλεγχος και εξόφληση των πάσης φύσεως δαπανών, μέσω τραπεζικών επιταγών ή ηλεκτρονικών εντολών μεταφοράς και πίστωσης των λογαριασμών των δικαιούχων, απόδοση των υπέρ τρίτων κρατήσεων, διενέργεια συμψηφισμών και απόδοση στο Δημόσιο και στα οικεία ασφαλιστικά ταμεία των οφειλών των δικαιούχων που αναγράφονται στις σχετικές βεβαιώσεις φορολογικών και ασφαλιστικών οφειλών, ενημέρωση των δικαιούχων και των φορέων για την έκδοση χρηματικών ενταλμάτων στο όνομά τους και την εξόφλησή τους, καθώς και τήρηση Μητρώων Κατασχέσεων και Εκχωρήσεων,
(ιζ) χορήγηση φορολογικών βεβαιώσεων, βεβαιώσεων αποδοχών καθώς και κάθε άλλου αναγκαίου εγγράφου, σύμφωνα με το αρχείο που τηρείται στη Μ.Ο.Δ.Υ.,
(ιη) παρακολούθηση της εξέλιξης των οικονομικών μεγεθών του Ε.Λ.Κ.Ε. και τήρηση των οδηγιών του Γενικού Λογιστηρίου του Κράτους σχετικά με την κατάρτιση και εκτέλεση του προϋπολογισμού του Ε.Λ.Κ.Ε.,
(ιθ) τήρηση αρχείου των Έργων που διαχειρίζεται ο Ε.Λ.Κ.Ε. σε ψηφιακή μορφή,
(κ) ενημέρωση των μελών της ερευνητικής κοινότητας μέσω της επίσημης ιστοσελίδας του ΕΛΚΕ του ΕΚΕΦΕ «Δ», αναφορικά με την αναζήτηση χρηματοδοτήσεων και παροχή οικονομικών στοιχείων για την υποστήριξη της συγγραφής και υποβολής προτάσεων για τη διεκδίκηση έργων/προγραμμάτων από εθνικούς, διεθνείς και ιδιωτικούς φορείς που αφορούν δραστηριότητες σύμφωνα με τους σκοπούς του άρθρου 1 του παρόντος Οδηγού, καθώς και κάθε άλλη απαραίτητη ενέργεια για τη διοικητική και οικονομική διαχείριση των Έργων που υλοποιεί ο Ε.Λ.Κ.Ε.
(κα) σύνταξη έκθεσης επί διαφωνιών με το Δ.Σ. για την πληρωμή δαπανών σε περίπτωση διαφορετικών απόψεων Δ.Σ και Προϊσταμένου/ης της Μ.Ο.Δ.Υ ως προς την συνδρομή των προϋποθέσεων πληρωμής ώστε να ακολουθηθεί, σύμφωνα με όσα ορίζονται στο άρθρο 69γ του ν. 4270/2014, η κατωτέρω διαδικασία:
αα. Παραπομπή από τον/την Προϊστάμενο/η της Μ.Ο.Δ.Υ, αιτήσεως στο Γενικό Λογιστήριο του Κράτους, σε περίπτωση που το Δ.Σ εγκρίνει την πληρωμή δαπανών που η ΜΟΔΥ δεν είχε εισηγηθεί ως πληρωτέες. Ο σχετικός φάκελος θα υποβάλλεται στη Γενική Διεύθυνση Δημοσιονομικών Ελέγχων του Γενικού Λογιστηρίου του Κράτους (ΓΛΚ),
ββ. Εξέταση της διαφωνίας από την εν λόγω Γενική Διεύθυνση του ΓΛΚ, η οποία αξιοποιεί και αξιολογεί αυτές για τη διενέργεια των ελέγχων, κατά λόγο αρμοδιότητας σύμφωνα με την κείμενη νομοθεσία και διατυπώνει έκθεση.
γγ. Η ανωτέρω έκθεση κοινοποιείται στο Ελεγκτικό Συνέδριο με κοινοποίησή της στο Δ.Σ και στον/στην Διευθυντή/ντρια του ΕΚΕΦΕ «Δ».
Σε κάθε περίπτωση, επί δαπανών που εγκρίνει το Δ.Σ. για τις οποίες δεν έχει εισηγηθεί θετικά η Μ.Ο.Δ.Υ, την κατά νόμο ευθύνη φέρουν τα μέλη του Δ.Σ. ενώ για δαπάνες που δεν έχει εισηγηθεί η Μ.Ο.Δ.Υ. δεν φέρει την κατά νόμον ευθύνη.